Комитет по науке и высшей школе является ответственным исполнительным органом государственной власти Санкт‑Петербурга за реализацию региональных составляющих входящих в состав национального проекта «Наука» федеральных проектов:
1. Развитие научной и научно-производственной кооперации;
2. Развитие передовой инфраструктуры для проведения исследований
и разработок в Российской Федерации;
3. Развитие кадрового потенциала в сфере исследований и разработок.
Кроме того, Комитет по науке и высшей школе является ответственным исполнительным органом государственной власти Санкт‑Петербурга за реализацию региональных составляющих входящих в состав национального проекта «Образование» федеральных проектов: «Новые возможности для каждого» и «Экспорт образования», а также является соисполнителем отдельных мероприятий федеральных проектов «Успех каждого ребенка», «Цифровая образовательная среда», «Молодые профессионалы (Повышение конкурентоспособности профессионального образования».